1、ISO9001质量管理体系、ISO14001环境管理体系和ISO45001职业健康安全管理体系三体系标准均有对内部审核的要求，但规定不完全一致。
2、内部审核时间的规定不一样：ISO9001质量管理体系标准要求按策划时间间隔;ISO14001环境管理体系标准要求按计划的时间间隔;ISO45001职业健康安全管理体系标准要求定期开展职业健康安全管理体系审核，因此，应明确审核的周期。
3、三个体系的要求不同。质量体系要满足质量管理和对顾客满意的要求，环境管理体系要服从众多相关方的需求，特别是法规的要求，职业健康安全管理体系关注组织内部员工的人身权利。
ISO9000标准是对顾客承诺;ISO14000标准是对社会和众多相关方(包括股东、保险公司等等)承诺;ISO45001是对员工及社会等相关方承诺。

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